La iglesia mudéjar contaba en origen con la tradicional estructura de nave única, dividida en dos tramos a los que abrían capillas laterales poco profundas y cubiertas con cañón apuntado en sentido transversal; una cabecera heptagonal carente de contrafuertes exteriores cuyos paños se encontraban abiertos alternativamente por vanos apuntados con derrame interno, a base de tres arquivoltas baquetonadas. El sistema de cubrición, a base de crucería sencilla de arcos diagonales apoyados en columnas adosadas al muro, con capiteles lisos.

Una serie de transformaciones realizadas en la primera mitad del siglo XVI alteraron la fisonomía de la fábrica mudéjar, al añadir un tramo más, bastante alargado, a los pies de la iglesia. La construcción de dicho tramo, que fue cubierto con bóveda de crucería estrellada de terceletes y ligaduras, supuso la unión de la iglesia con la torre mudéjar, que se levantaba exenta a varios metros de la misma, y a la que quedó adosada por sus lados norte y este a los pies de la iglesia, si bien presenta un descentramiento respecto a su eje.
Este nuevo tramo, que se levantó en piedra sillar, quedaba culminado en su parte superior externa por una galería de arcos apuntados.

A este momento también corresponden la dos pequeñas capillas situadas a ambos lados del presbiterio, que fueron cubiertas asimismo por bóveda de crucería estrellada, al igual que la sacristía adosada a la cabecera.

Las transformaciones continuaron durante el siglo XVIII con la ampliación de las capillas laterales abiertas a los tramos de la primitiva fábrica mudéjar, que se cubrieron con cúpula sobre pechinas las del tramo contiguo al presbiterio, presentando la del lado de la epístola, dedicada a la Virgen de la Peana, cúpula con linterna; por otro lado, las capillas abiertas al tramo contiguo se cubrieron con cúpula elíptica la del Evangelio y de lunetos la de la Epístola.

La iglesia se completa interiormente con un coro elevado, a los pies, sobre una bóveda de crucería estrellada.

En el muro occidental se abre una portada en arco de medio punto flanqueada por pilastras sobre la que corre un entablamento y una hornacina avenerada que alberga una imagen moderna realizada en alabastro de la Virgen de la Peana, patrona de la localidad.